Fazer novo design para site com plataforma antiga

Um cliente me solicitou que fizesse a criação de um novo design pro site dela utilizando HTML5 já que ela desejavas diversas galerias e efeitos no site. Pois bem, após quase 1 mês conseguimos aprovação final do design. Daí então ela nos solicitou que instalássemos esse design dentro de uma instalação WP 3.0.1 que ela possuía.

Perguntamos a ela se poderíamos instalar uma versão mais recente já que tínhamos criado o site já com a versão 3.5.1. então bastaria publicar o site. Mas ela disse que já aprendeu a usar a versão atual (3.0.1) e não quer que alteremos nada. Dessa forma fizemos toda adaptação da versão antiga para que o novo tema que criamos fosse suportado.

Após quase 2 dias finalizamos todos os ajutes de diversos plugins que ela já usava e agora quando formos publicar no servidor de testes de nossa empresa está aparecendo a bendita mensagem:

PHP Warning: MySQL server has gone away on sitepor500.com.br
Service unavailable
Warning: MySQL server has gone away query: INSERT INTO (aqui tinha um monte de queryes)

O servidor de testes está funcionando perfeitamente e inclusive consigo abrir o db no phpmyadmin sem problema nenhum. O banco de dados está com toda certeza funcionando. Com certeza é um problema dessa bendita versão antiga mas eu procurei por diversos fóruns e não acho uma solução.

Grato por toda e qualquer ajuda.