Problema com Multisite depois de ter sido movido

Olá

Fiz cópia integral da pasta de instalação do WP para outro servidor (na minha intranet, sou eu que os instalei e configuro), importei o .sql para a nova base de dados e alterei a configuração do wp-config a nível das permissões de acesso à BD.
* Já verifiquei as permissões das pastas
* Já activei o mod_rewrite e confirmei que estava a funcionar
* Já verifiquei as configurações do .htaccess colando o código que aparece no WP
* Já actualizei o /etc/apache2/apache2.conf com as definições

<Directory /var/www/portal/>
        Options FollowSymLinks
        AllowOverride All
</Directory>

Inicialmente não conseguia aceder sequer às páginas dentro do site principal do multisite e fui aos permalinks e mandar gravar, a partir daí ficou tudo a funcionar correctamente, no entanto…
Quanto tento aceder a qualquer um dos multisites recebo a mensagem

Not Found

The requested URL /index.php was not found on this server.

Já confirmei que não existe nenhuma pasta com o mesmo nome do subsite e nenhum funciona.
Já tentei criar um novo e mostra o mesmo erro quando tento aceder a qualquer parte do site (raiz ou wp-admin ou wp.login)

Alguém tem alguma ideia mais?

Obrigado desde já