Consegui.
Tive que baixar o WP 3.1.3 descompactei as pastas e fui substituindo uma por uma, via FTP. Salvei as que eu ia modificar antes no computador, em caso de aparecer algum erro, mas não apareceu!
Essa atualização automática é só dor de cabeça, melhor fazer manual mesmo.
Obrigada pessoal