Olá colega.
Obrigada pela atenção.
A exclusão da linha resolveu parcialmente o problema, jogando o logo pra frente do menu. Porém eu gostaria de saber como jogá-lo pra cima da página, subindo a imagem, e não por cima do menu.
Imagino que seja algo no header.php, mas ja analisei o código e não consegui desvendar o problema. Ou seria coisa do CSS mesmo?