Amigo aconteceu o mesmo aqui, fiz o seguinte:
1 – Troquei o nome da pasta plugins “plugins_”
2 – Voltei para a página de update do admin, clica em atualizar banco de dados, aí espera concluir o processo
3 – Terminado o processo 2 volta o nome original da pasta para “plugins”
4 – Agora pode confirmar a mensagem do processo 2
Dessa forma não se perde os plugins instalados…
Zappe.